Het microbioom is een verzameling van alle micro-organismen die in een bepaalde omgeving voorkomen, zoals de huid, de darmen of de lucht. Deze micro-organismen omvatten bacteriën, schimmels, virussen en andere micro-organismen. Het microbioom speelt een belangrijke rol bij het handhaven van de gezondheid van een organisme, omdat het de balans tussen de verschillende micro-organismen reguleert.