Functioneel beheer is het proces waarbij een organisatie de functionaliteit van haar informatiesystemen beheert. Het omvat het beheer van de technische infrastructuur, de software, de gegevens en de processen die nodig zijn om de informatiesystemen te laten functioneren. Het doel van functioneel beheer is om de informatiesystemen te laten voldoen aan de bedrijfsbehoeften en om de kwaliteit van de informatiesystemen te waarborgen.